M.shark - Plateforme Spectrométrie de masse

M.shark appartient à l'unité de service BioCore et au Centre de Recherche en Nutrition Humaine Ouest (CRNH-Ouest)*.

Nos travaux portent principalement sur les maladies métaboliques et les risques cardiovasculaires associés, par l'exploration ciblée ou non (in vivo et in vitro) des composants des lipoprotéines humaines et animales. La plateforme M.shark s'intéresse également à la mesure des flux métaboliques et lipoprotéiques via l'utilisation de traceurs enrichis en isotopes stables.

*Le CRNH-Ouest est un groupement d'intérêt public qui fédère les unités de recherche de l’Ouest de la France autour d’une thématique commune : la nutrition humaine et la prévention des maladies métaboliques (obésité, diabète, cholestérolémie). Le CRNH-Ouest comprend actuellement plus de 200 chercheurs équivalent temps plein qui travaillent en synergie sur les thèmes suivants : la nutrition néonatale, le système nerveux entérique et sa relation avec le système nerveux central, les allergies alimentaires, et les lipides alimentaires et les pathologies chroniques.
Le CRNH-Ouest s'appuie sur les équipes des unités de recherche INRAE, Inserm, Oniris, et universitaires (Nantes Université) et des services hospitaliers (CHU Nantes). Il s’appuie également sur des plateformes de recherche et de service, comme M.shark, qui est aussi rattachée à la structure CORSAIRE de Biogenouest.

M.shark propose divers types d'analyses dans tous types de matrices biologiques (in vivo, in vitro, animales et humaines).

Nous travaillons régulièrement sur les matrices suivantes :

• Sérum, plasma
• Tissus
• Urines
• Lait maternel
• Selles
• Cellules

Et réalisons des analyses de type :

• Analyses non ciblées (lipidomique, métabolomique et protéomique)
• Analyses quantitatives ciblées (lipides et apolipoprotéines, acides aminés et protéines, acides organiques, sphingolipides permettant d’approcher la résistance à l’insuline, méthylamines et acides gras à chaine courte permettant d’approcher le microbiote intestinal , xénobiotiques...)
• Analyses cinétiques dans des protocoles impliquant l'utilisation de traceurs enrichis en isotopes stables (fluxomique protéines et métabolites)
• Analyses structurales et élémentaires (mesure de masses exactes)

M.shark est dotée des équipements suivants :
 

• 2 x GC-EI/CI-MS (Q)
• GC-C-EI-IRMS
• 2x UPLC-ESI-MS/MS (QqQ)
• UPC²-ESI-MS/MS (QqQ)
• UPLC-ESI-HRMS (Q-TOF)
• nanoLC-ESI-HRMS (Orbitrap)
• Ultracentrifugeuse